Le partenariat est ainsi au cœur du fonctionnement qui est composée de 3 organes de gouvernance :
L’Assemblée générale est organisée en 4 collèges : celui des institutions de la Polynésie française, celui des communes et de leurs groupements, celui de l’État français et celui des membres associés.
Le Conseil d’administration est composé de 19 membres de l’association représentant chacun des collèges.
Le Bureau